池上→恵比寿でダブルスタンプ→Ｈ線・他線乗換のない駅→仲御徒町
→広小路→Ｇ線→末広町→秋葉原探索（ぉ　→三越前→Ｚ線各駅
→永田町/見附→Ｍ線→中野坂上→ｍ線各駅→Ｍ線各駅→荻窪
→四ツ谷→Ｎ線→目黒周り池上

Ｚ線について。
スタンプラリーのセオリーである「２駅進んで１駅戻る」が有効ではありません。
と言うのも、駅間が長めであることと、ホームとスタンプ設置位置が遠い為。
電車降りて、改札階まで上がってスタンプ押して、またホームに戻ってくる。
すると、先程まで乗っていたのと同じ方面の次の電車が入ってくるくらいのタイミングです。
そんなんですから、素直に１駅ずつ回るほうが押し間違いなども減るので良いと思います。

Ｍ線中野坂上～荻窪間について。
中間４駅はいずれも対向式です。
スタンプは、片側にしか用意されていませんので、次の順で回ることをお勧めします。
（坂上）→東高→荻窪→南阿→新高→新中→（坂上）
東高円寺は荻窪方面の改札、南阿佐ヶ谷・新高円寺・新中野は池袋方面の改札に設置です。
逆線からだと、地下通路での連絡になりますので、気をつけてください。